Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms