Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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