Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CHD3Q12873 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CHD3Q12873 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CHD3Q12873 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CHD3Q12873 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CHD3Q12873 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CHD3Q12873 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHD3Q12873 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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