Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SREBF2Q12772 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SREBF2Q12772 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms