Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms