Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA2P62736 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA2P62736 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms