Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFM1P61960 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFM1P61960 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFM1P61960 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFM1P61960 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFM1P61960 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UFM1P61960 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFM1P61960 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFM1P61960 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFM1P61960 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UFM1P61960 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UFM1P61960 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UFM1P61960 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UFM1P61960 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UFM1P61960 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UFM1P61960 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UFM1P61960 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFM1P61960 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms