Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms