Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPN3P20807 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms