Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF3P18847 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATF3P18847 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF3P18847 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF3P18847 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms