Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XBP1P17861 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XBP1P17861 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XBP1P17861 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XBP1P17861 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms