Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NR2F1P10589 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms