Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIA4O75335 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms