Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR3AO14802 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms