Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf60A6NFR6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms