Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L4A6NEF3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L4A6NEF3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms