Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
DCAF1Q9Y4B6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DCAF1Q9Y4B6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms