Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms