Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA2Q9UL42 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms