Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2LQ9UL33 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms