Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RIMBP3Q9UFD9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3Q9UFD9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms