Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms