Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC4Q9NTJ3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMC4Q9NTJ3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms