Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GSDMCQ9BYG8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms