Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIFKQ9BYG3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NIFKQ9BYG3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms