Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf16Q9BUW7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms