Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUN5

CCDC28B, Coiled-coil domain-containing protein 28B, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC28BQ9BUN5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC28BQ9BUN5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms