Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CMSS1Q9BQ75 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CMSS1Q9BQ75 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms