Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp3Q91W36 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms