Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms