Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC85BQ15834 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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