Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCIRG1Q13488 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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