Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM2Q13029 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
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