Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms