Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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H3F3AP84243 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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H3F3AP84243 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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H3F3AP84243 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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H3F3AP84243 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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H3F3AP84243 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H3F3AP84243 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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