Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTBP60709 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTBP60709 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms