Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HLA-FP30511 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HLA-FP30511 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms