Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD247P20963 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD247P20963 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD247P20963 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD247P20963 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD247P20963 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD247P20963 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD247P20963 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms