Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RGPD1P0DJD0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD1P0DJD0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms