Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGAVP06756 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms