Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SETD1AO15047 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SETD1AO15047 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms