Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MBD3L3A6NE82 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms