Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F8A0AVK6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms