Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNRF3Q9ULT6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNRF3Q9ULT6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms