Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL9Q9P2J3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms