Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms