Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AMBRA1Q9C0C7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms