Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TSPAN18Q96SJ8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TSPAN18Q96SJ8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms