Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMTK3Q96Q04 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms