Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CMTM3Q96MX0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms